
2023年9月26日,宁夏大学刘敦华教授团队在Food Chemistry(IF=8.8)上发表题为“TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration”的研究文章。研究人员利用TMT定量蛋白质组学共鉴定出377个差异表达蛋白(DEPs)。转铁蛋白、铁蛋白、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX) 4和血红素加氧酶1等15种DEPs参与脂质过氧化、Fe2+ 和Fe3+ 转化、铁离子积累和线粒体氧化应激诱导铁死亡。此外,化学致癌物ROS、谷胱甘肽代谢、HIF-1和PPAR等信号通路可能通过影响游离铁过载和GPX4失活来促进铁凋亡。该研究成果中 拜谱生物制品 为其提供 TMT蛋白酶组学 的检测与分析,发现的差异蛋白有助于拓展屠宰后牛肉储存过程中铁死亡的生理和分子机制的认识。
PART 01
理论研究毕竟
论述工作员探求跟随冷冻准确周期延缓羊肉片的强度标准、持水水平、顏色、化合物钙纯度铁纯度、ROS、脂质过化合物物、MDA、GSH和GPX4水平来评价指标腹肌组识神经元的铁窒息死亡动态。成果表现,冷冻准确周期延缓后,羊肉片的强度标准在第3天和第6天有明显减低;持水水平大幅度降低;顏色变深,耗尽有光泽,鲜桔色成为暗桔色。还有就是,化合物钙纯度铁、活性氧氧和MDA的纯度有明显添加,神经元凋亡率有明显偏高。 论述工作人员生成与众不相同冷库时间间隔的手臂相关肌肉检样的蛋清质,接下来采取SDS-PAGE解析,蛋清质条带在与众不相同时段分布不均均且类似的(图1a)。跟据蛋清在与众不相同检样中的表达方法的情况,解析找到同时条组检样的中十位数类似于同时条平均水平(图1b),描述手臂相关肌肉检样蛋清质兼具稳定的组内类似的性和组间差别性。 蛋清质组学共认定会出1996种蛋清质。以B0为比较组,选择B1、B2、B4和B6中的蛋清进行异同理解剖析,共认定会到374个DEPs。将火山图可视化浅析,并会按照FC > 1.2、FC < 0.86和P < 0.05两人标淮剖析DEP。最终最后如图是1c-f右图,在B1/B0、B2/B0、B4/ B0和B6/B0中分刘海别认定会出22、33、73和140个DEPs,在这当中分刘海别上涨6、11、32和85个,降低16、22、41和5两个。聚类分析法形式分析评估了异同冷藏箱时间间隔段脂肪组识组识中蛋清质的理解,最终最后展现脂肪组识蛋清理解异同由于贮藏时间间隔的加剧而加剧(图1g)。
图1| 不相同冷冻周期的手臂肌肉仿品蛋白质含量质组学(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图2| 对比速冻时的腹肌备样对比蛋清了解(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
表1 铁突然死亡蛋白酶肽的PRM化学发光法分析一下(表源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图3| 根据KEGG聚集对比分析展示球蛋白的铁枯死系统(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 202
PART 02、拜谱总结ppt
作者利用TMT定量蛋白质组学鉴定发现15个参与铁死亡调节的DEPs,包含铁离子运输、 Fe2+ 和 Fe3+转化、脂质氧化途径、氧化还原调节和含铁蛋白降解途径。铁死亡依赖于铁离子积累、GPX4失活和脂质过氧化。此外,通过对DEPs的蛋白质和途径相互作用分析,发现了37条代谢途径,通过调节细胞铁超载、细胞膜或细胞器膜脂质氧化和ROS积累来促进铁死亡。铁下垂机制的发现可能为提高牛肉冷藏品质的相关研究提供新的视角,可能有助于预测肉类的潜在质量和鉴定铁下垂的生物标志物。这一过程中拜谱海洋生物提供了TMT化学发光法球蛋清组学新系统管理,拜谱怪物已研发项目管理完毕并开发了早熟早熟的转录组学、球蛋清组学、分解代谢组学已经两组学联和好产品新系统管理标准,欢迎致电咨询!
基准期刊论文:Liu J, Liu D, Hu Z, Hu Y, Yu X. TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration. Food Chem. 2023 Sep 26. doi: 10.1016/j.foodchem.2023.137596.